
W dniu 06.12.2023 r. w Katedrze Mikrobiologii został zainstalowany aparat CFX Opus 96 do przeprowadzania reakcji qPCR firmy Bio-Rad. Sprzęt został zakupiony ze środków pozyskanych w konkursie na zakup aparatury badawczej organizowanym w ramach programu „Inicjatywa doskonałości – uczelnia badawcza” (IDUB). Beneficjentem konkursu jest dr hab. inż. Krzysztof Skowron, prof. UMK reprezentujący wyłaniające się pole badawcze „One Health – antimicrobial stewardship in human and veterinary medicine”.
Aparat CFX Opus 96 pozwala na przeprowadzenie reakcji multipleks PCR w oparciu o 5-kanałów z wykorzystaniem barwników SYBR GREEN, EVAGREEN, FAM, HEX, VIC, TET, Cal Gold 540, ROX, TEXAS RED, Cal Red 610, Cy5, Quasar 670, Quasar 705 oraz wyposażony jest w dodatkowy kanał dostosowany do techniki FRET (Förster Resonance Energy Transfer). Urządzenie umożliwia analizę ekspresji genów poprzez względną analizę ilościową (ΔCq) lub ekspresji znormalizowanej (ΔΔCq) z porównaniem nieograniczonej ilości wartości Cq oraz analizę z zaprogramowanym punktem końcowym pomiaru „end-point” i analizę alleli (dyskryminacja alleli). Ponadto dzięki zakupionemu oprogramowaniu możliwe jest genotypowanie drobnoustrojów w oparciu o termiczną denaturację dsDNA z wykorzystaniem techniki HRM (High Resolution Melt).
Całkowity koszt zakupionego aparatu wraz z oprogramowaniem Maestro oraz HRM to 202 320 zł.