Relacja z pobytu studentów zagranicznych w ramach programu TABMED

W dniach 01 – 31. 08 2023 gościliśmy 5 studentów farmacji w ramach letniego programu TABMED (Torun and Bydgoszcz Medical Summer Program) w Katedrze Chemii Organicznej. Zrealizowano 4 tematy w obszarze badań modelowania molekularnego oraz 1 temat z zakresu syntezy związków organicznych; wykaz tematów »

W trakcie stażu studenci w grupie modelowania molekularnego zostali zapoznani z nowymi metodami projektowania leków w oparciu o chemię obliczeniową in silico.

Obecnie każdy lek wprowadzany na rynek musi przejść szereg badań obejmujących modelowanie molekularne. W konsekwencji metody obliczeniowe in silico są szeroko stosowane w farmacji, medycynie i dziedzinach pokrewnych. Farmakokinetyka opisuje procesy dotyczące losów leku/ksenobiotyku w organizmie. Określa w jaki sposób organizm wpływa na określony lek/ksenobiotyk po podaniu poprzez mechanizmy wchłaniania
i dystrybucji, a także zmiany metaboliczne substancji w organizmie. Farmakodynamika dostarcza informacji o efekcie działania w konkretnym miejscu działania leku w organizmie. Celem badań było określenie właściwości fizykochemicznych i farmakodynamicznych oraz niektórych aspektów farmakokinetyki wybranych substancji o działaniu przeciwnowotworowym. Podczas stażu studenci zapoznali się i poszerzyli wiedzę z metodami komputerowo wspomaganego projektowania leków opartych o bio- i chemoinformatyczne techniki badań. W ramach stażu każdy student przeprowadził eksperymenty in silico z wykorzystaniem specjalistycznego oprogramowania do projektowania leków. Ponadto nasi goście byli aktywnie angażowani w projektowanie innych eksperymentów, analizę danych, dyskusję wyników, a także formułowanie wniosków z badań. Finalnie podczas pożegnalnego spotkania stażyści prezentowali wyniki swoich eksperymentów w formie krótkich referatów badawczych.

Student realizujący projekt syntetyczny miał okazję zapoznać się z technikami syntezy i oczyszczania stosowanymi w laboratorium chemicznym. Zaplanowanym zadaniem była synteza nowych pochodnych 1,2,4-triazolu oraz określenie ich potencjalnej aktywności biologicznej za pomocą metod obliczeniowych. Stażysta najpierw otrzymał amidrazony, a następnie w reakcjach z bezwodnikiem glutarowym ich pochodne acylowe, które następnie poprzez cyklizację w środowisku zasadowym przekształcił w pochodne 1,2,4-triazolu. Praktycznie opanował pomiar temperatury topnienia związków, przeliczania wydajności reakcji oraz opisu dokumentacji eksperymentów. Dla otrzymanych związków wykonał obliczenia potencjalnej aktywności biologicznej z wykorzystaniem programu PASS oraz parametrów reguły 5 Lipińskiego, które pozwoliły określić ich wysoka dostępność biologiczną.

Oprócz rozwoju naukowego stażyści uczestniczyli w bogatym programie kulturalno-wycieczkowym. Umożliwiono im poznanie historii i architektury Bydgoszczy, Torunia, Gdańska, Poznania, Wrocławia, Krakowa i Warszawy. Odbyły się też liczne wykłady i warsztaty w zakresie nauk medycznych obejmujące zagadnienie z zakresu biochemii, komunikacji w relacji z pacjentem, budowy molekularnej leków, symulacji medycznej. Goście zwiedzili liczne muzea m.in. Muzeum Mydła i Historii Brudu, Explozeum. Podczas wizyty w toruńskim Niewidzialnym Domu nasi goście mieli możliwość poczucia i zrozumienia poruszania się i funkcjonowania osób niewidomych. Samodzielnie zorganizowali wycieczki po Europie odwiedzając Budapeszt, Pragę, Amsterdam czy Berlin. Zorganizowaliśmy również dzień międzykulturowy podczas którego każdy student przybliżył nam kulturę, architekturę, przyrodę swojego kraju.

Relacja z pobytu ze stażu Sandry Aiyabei; University of Nairobi, Kenya »