Katedra Chemii Fizycznej
prof. dr hab. n. chem. Piotr Cysewski
Strona własna jednostki: http://chemfiz.cm.umk.pl/
Tematyka badawcza:
GRUPA TEMATYCZNA A
Opis właściwości zasad azotowych oraz ich pochodnych zmodyfikowanych działaniem rodnika wodorotlenowego.
- Reaktywność chemiczna
Charakterystyka takich właściwości jak równowagi tautomeryczne, właściwości kodujące, parametry elektrostatyczne w oparciu o metodykę in silica.
Realizacja: prof. dr hab. Piotr Cysewski - Oddziaływania boczne (stakingowe)
Charakterystyka zdolnościach stakujących nukleozydów zmodyfikowanych i porównanie z analogicznymi właściwościami kanonicznych nukleozydów. - Trwałość wiązania N-glikozydowego
Wyznaczenie energii wiązania N-glikozydowego oraz mechanizmu nieenzymatycznej hydrolizy nukleozydów. - Właściwości trifosforanów
Opis właściwości trifosforanów zmodyfikowanych działaniem rodnika hydroksylowego.
Realizacja: dr Beata Szefler - Modelowanie sfer solwatacyjnych
Wyznaczenie różnic w oddziaływaniach z cząsteczkami polarnego oraz i niepolarnego rozpuszczalnika oraz charakterystyka struktury solwatacyjnej.
Realizacja: mgr Katarzyna Kozłowska - Opis wpływu środowiska na właściwości parowania zasad azotowych oraz ich wolnorodnikowych pochodnych
Charakterystyka zdolności kodujących z uwzględnieniem wpływu zjawisk solwatacyjnych.
Realizacja: prof. dr hab. Piotr Cysewski
GRUPA TEMATYCZNA B
Projektowanie molekularne leków oraz opis mechanizmów ich działania – modelowanie reakcji enzymatycznych
- Opis właściwości wybranych leków interkalujacych
Charakterystyka strukturalna, energetyczna oraz dynamiczna wybranych związków chemicznych o charakterze leków interkalujących oraz ich oddziaływań z cząsteczką DNA. - Opis właściwości przeciw-uzależnieniowych ibogainy i jej pochodnych
- Opis właściwości chemicznych oraz aktywności biologicznej pochodnych kwasu 1,2,4-triazoloakrylowego
Charakterystyka strukturalna, energetyczna, elektrostatyczna, właściwości kwasowo-zasadowych pochodnych kwasy TrA i jego pochodnych. - Mechanizm hydrolizy glikozydów zmodyfikowanych działaniem rodnika wodorotlenowego
- Mechanizm hydrolizy trifosforanów do difosforanów nukleozydów zmodyfikowanych działaniem rodnika wodorotlenowego
- Metodyka enzymologii obliczeniowej